1988年,花山岩画被国务院定为全国重点文物保护单位。1998年,以花山岩画为中心的花山风景区被定为国家级风景旅游名胜区,成为与桂林漓江、桂平西山齐名的广西三大国家级风景旅游名胜区之一。2001年开始,国家文物局实施花山岩画保护计划,对保护岩画进行深入研究。2003年6月,广西启动花山岩画世界文化和自然“双遗产”的申报工作,2004年11月,花山岩画以国内罕见的“双遗产”形式,被国家列入申报世界文化遗产预备清单。 2007年,灵渠和花山被列入《中国世界文化遗产预备名单》。2008年开始,广西壮族自治区全面启动宁明花山申报世界性文化遗产的工作。“申遗”成功,可让花山得到有效保护。虽说取得初步成功,但任重而道远,毕竟预备名单中有全国35个项目,而中国每年获得正式批准的只有一两个项目。