心血管科为国家卫计委临床重点专科，儿科为国家中医药管理局重点专科，针灸科为国家临床重点专科建设单位，心血管科、骨伤科为国家中医药管理局重点专科建设单位，中医骨伤科、肾病科、针灸科、儿科、脑病科为甘肃省重点中医药专科；脾胃病科、中药炮制及质量控制技术研究中心为甘肃省重点中医药专科建设单位；脾胃病科、心血管科、肾病科设有国家二级临床实验室。医院设有甘肃省中医药防治慢性病重点实验室、甘肃省中西医结合心血管临床医学中心。
