pH值,缓冲液的pH值对于蛋白结合离子交换层析有非常大的影响,需要先摸索出合适的pH值,既能保证蛋白结合上离子交换层析,又不会出现不稳定沉淀的情况。
盐浓度,盐浓度是离子交换层析洗脱的关键,需要摸索出蛋白能在什么样的盐浓度下被洗脱,且洗脱后纯度能够达到最初的要求。
柱体积,尽管各种离子交换层析均有理论结合蛋白量,但各种蛋白情况不一样,需要摸索出能够完全结合目的蛋白合适的柱体积。既不会太大造成洗脱浓度过稀,也不会太小造成目标蛋白过载。
温度,温度可能会造成蛋白变性等等。