A、长期地理隔离可能导致生殖隔离的产生，A错误；B、东北虎和华南虎是同一物种，但由于地理隔离，不能自由交配，B错误；C、物种可以繁衍后代，但是单倍体小麦不可育不能成为一个新物种，C错误；D、四倍体西瓜是可育，是新的物种，D正确．故选：D．
