A、种群基因频率的改变是产生生殖隔离的前提条件，A正确；
B、同一物种不同种群基因频率的改变导致种群基因库的差别越来越大，进而产生进化，B错误；
C、地理隔离能使种群基因库产生差别，产生进化，但不一定导致生殖隔离，C错误；
D、自然选择过程中，直接受选择的是表现型而不是基因型，进而导致基因频率的改变，D错误．
故选：A．
a、基因频率的改变意味着生物发生了进化，但不能说明形成了新物种，a错误；
b、生物可以不经过地理隔离而产生生殖隔离，b正确；
c、生物进化的方向是由自然选择决定的，c错误；
d、种群内基因频率改变的偶然性随种群数量下降而升高，d错误．
故选：b．
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