A、突变和基因重组为生物进化提供了原材料，自然选择决定生物进化的方向，A正确；B、生物进化的实质是种群基因频率的改变，所以种群基因频率的变化意味着生物进化了，但不能代表新物种的产生，B错误；C、隔离是新物种形成的必要条件，C正确；D、共同进化是生物多样性形成的原因，D正确．故选：B．
