Y染色体和X染色体有同源部分和非同源部分,同源部分它们的基因是一样多的,但是因为X染色体比Y染色体长了非同源的一段,因此X染色体比Y染色体多了非同源那一段的基因.但果蝇的Y染色体比X染色体长,因此因此上述结论不一定,但大多数是这样的.