机械运动指的是物体位置的变化.A、飞机在天空中飞行,相对于地面来说飞机的位置发生了变化,所以是机械运动;B、月球绕地球公转,相对于地球而言月亮的位置发生了变化,是机械运动;C、苹果由绿变红,是苹果内部发生了化学反应,苹果变熟了,但苹果的位置没有变化,不是机械运动;D、河水在河中流,河水相对于河岸的位置发生了变化,是机械运动.故选C.