本质上没有什么区别，如果你对管辖权提出异议，就要给法院提交管辖权异议申请书，也就相当于管辖权异议书，如果一定要做区分的话，那就是管辖权异议申请书是在申请的时候向法院提交的资料，而管辖权异议书，可以是在向法院提交管辖权异议申请书后向法院提交的答辩书一类的东西。
