三九企业集团是国务院国有资产监督管理委员会直接管理的国有大型中央企业。
下属企业包括：
三九集团制药企业
深圳三九药业有限公司
三九医药股份有限公司
乐山三九长征药业股份有限公司
北京三九科技有限公司
中生三九药具发展有限公司
三九胃泰(香港)有限公司
万荣三九药业有限公司
四川三九健康产业发展有限公司
武汉中敏基因工程有限公司
浙江三九邦而康药业有限公司
深圳三九胃泰股份有限公司
广州三九科工贸实业发展公司
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