A、标志重捕法一般用于活动能力强的较大的动物，土壤中小动物类群丰富度的调查一般采用取样器取样法进行调查，A错误；B、同一时间分别采集落叶量不同地域的表层土样，比较不同地域的动物类群丰富度，B正确；C、不同土壤中小动物类群丰富度的调查时，肉眼看见与看不见的动物都可以调查，只是方法不同而已，其中统计肉眼可见的小动物时可以用记名计算法，C错误；D、对于无法知道名称的小动物可用目测估计法，D错误．故选：B．
