解答：解：过B作BF垂直DC的延长线于点F，∵∠ABC=∠CDA=90°，BF⊥CD，∴∠ABE+∠EBC=∠CBF+∠EBC，∴∠ABE=∠CBF；又∵BE⊥AD，BF⊥DF，且AB=BC，∴△ABE≌△CBF，即BE=BF；∵BE⊥AD，∠CDA=90°，BE=BF，∴四边形BEDF为正方形；由以上得四边形ABCD的面积等于正方形BEDF的面积，即等于9，∴BE2=9，即BE=3．故选B．
