1,如果蛋白是分泌表达，直接分离上清（传统的方法：离心去细胞和细胞碎片→过滤（0.45或0.22nm）→蛋白纯化（蛋白纯化是一个很复杂的过程，这里一笔带过了，电泳，层析，沉淀等方法）→获得目的蛋白 2，胞内蛋白，首先裂解细胞(这样细胞内的杂蛋白。
