我是一名在职的六级伤残军人，请问如何报销医疗费，能报销百分之多少？

一个应战五级残疾军人（2005年7月以后已经不叫伤残军人的名称了），这样回答你：
七级残疾军人根据国家《军人优抚优待条例》的规定：“七级至十级残疾军人旧伤复发的医疗费用，已经参加工伤保险的，由工伤保险基金支付，未参加工伤保险，有工作的由工作单位解决，没有工作的由当地县级以上地方人民政府负责解决；七级至十级残疾军人旧伤复发以外的医疗费用，未参加医疗保险且本人支付有困难的，由当地县级以上地方人民政府酌情给予补助。”
除了抚恤金领取以外，对医疗费用（这里指的是你父亲）现在大部分地区就是参加医保门急诊可以报销一部分的，个人支付过高的，影响生活的，可以向民政局提出申请报销50％。
我建议你不要去找镇民政部门而是到县市级民政局优抚科，带上你的医疗发票、病历等等证明，直接向优抚科提出申请（镇民政是没有权利的）；
如果事实是造成残疾军人生活困难的，而民政局又不予补助的，那你就可以依据上述法规向属地人民法院行政庭提起行政诉讼（必要时可以到当地的律师协会申请法律援助－－免费的），告民政局不作为，行政诉讼还有一个好处就是除了病历、发票证据以外，就是被告民政局举证。应该能够得到法律的支持。
当你起诉开始时，民政局就不会掉以轻心了，更不会讲“政策就是这样规定的”，很有可能在还没有开庭就把你们的问题解决了，然后让你撤诉（他们是怕败诉的，也怕被残疾军人起诉的，多丢人的事，政绩、升官、仕途都完了）

根据民政部、财政部、劳动和社会保障部《关于印发<一至六级残疾军人医疗保障办法>的通知》（民发〔2006〕199号）：
有工作单位的残疾军人随单位参加基本医疗保险，按规定缴费。无工作单位和所在单位无力参保的残疾军人经劳动保障、民政、财政部门共同审核确认后，由民政部门统一办理参保手续，医疗保险费以上年度在岗职工平均工资作为缴费基数，其单位缴费部分，由县财政安排资金。
残疾军人参加基本医疗保险个人缴费确有困难的，由残疾军人所在单位帮助解决；单位无力解决和无工作单位的，经劳动保障、民政、财政部门共同审核确认后，由县财政解决。
从以上可知，你参加医疗保险，单位和本人有能力缴纳保险费用的，分别由单位和本人负担单位部分和个人部分，无力缴纳的，需经三部门联合确认后，由县财政解决。
所以你要解决入保问题，首先单位负责人沟通协调好，毕竟如果大家都没有入的话，单你自己入说不过去，反过来，大家都入了，就你没有入也是不合理的。其次要寻求民政部门的帮助，最后在以上都不解决问题的情况下，并且你一定要入的话，可以进行信访（毕竟这也是最后一步了）。