测序深度代表了序列被探针组覆盖的次数，次数越高，测序结果的识别就越精确，后续的统计分析也就越准确。如果做肿瘤、低频突变研究，建议测序深度至少应达到150×以上。如果只看经典SNP、非低频突变，测序深度也至少应该在30×以上。测序深度换算方法：一般目标区域的捕获效率在60-70%，安捷伦和罗氏等外显子捕获试剂盒的目标区域大小在60Mb左右，即测序深度=10G*60%/60Mb=100×。
