the problem is that we are late.中that为什么不能换成what，可以讲一些基本的句子成分吗？

1，that相当于古汉语中的“之”字，没有意义，只起到一个引导作用，且不再从句中做句子成分。表示后边将是一个从句。what相当于古汉语中的“所......的”，起到双重作用，既引导从句，又在从句中起名词的作用，作主语，表语，宾语。因此上面的句子we are late,是完整的不缺成分，不能用what;
2,定语从句中的引导词要分清他们在从句中的作用，如：which代替“物”，又在定语从句中做主语或宾语，where指代前边先行词地点，又在从句中做地点状语。
The house that/which he looked for is near the river.（that/which做look for 的宾语）
The house where he lived in near the river.( he lived 缺地点状语)live 不及物动词，只能接状语。
The house ,the windows of which face the street ， belongs to an old man.(which代替前边的house)房子的窗子。
3，with his interest in studes almost _是用lost，假定把interest看做逻辑主语，兴趣是被丧失，丢失，所以用lost,表示已经丧失，结果一完成。而being lost 正在被丢失说不通。这是一种用“介词+名词+动词+其他成分”独立结构。判断这个名词和动词之间的动宾关系主动被动来决定用ed 形式还是ing.形式。
如：
The man came in, with a book held under his arm.(书被夹)。
The teacher entered the classroom, with his eyes looking at all of us(眼睛看着我们)眼睛看而不是“被看”，所以用ing,
4. 学单词之初就得连同vt.及物vi不及物一起记住，不过有的词还是很容易判断是否带宾语；不能带的就是不及物动词。如：
He is walking on the road.(不及物).
I lost a pen..(lost及物，带宾语a book).
They are walking the dog.(遛狗)。不是“走狗”，walk 带了宾语dog.

the problem is that we are late.
这是个表语从句。表语从句部份，we are late 有完整的系表结构，所以用that 引导。

什么时候用what呢？

从句里的结构不完整，需要what来充当比如主语、宾语的时候

比如：the problem is what do we have.

we have 是不完整的句子，完整的应该是 we have something. what 指代 something，所以用what引导。

其他例子：
the problem is where can we sleep

we sleep可以补充状语，we sleep some place, where 指代some place

关于with
用being lost, with 引导的都是句子中的状语部份，说明句子已经有动词了。一个句子里只能有一个动词，所以with后面的动词一定是其他形式的，ing形式的，或者不定式

及物动词，不及物动词
“及物”顾名思义就是后面直接跟名词
“不及物”就是后面不直接跟名词，在动词与名词之间需要用介词来做桥梁。

讲得太学术化也不容易理解，就这样说吧：你给的这个句子，翻译过来时问题是我是迟到了，这里的主语是the problem ，而that在we are late中是不占成分的，通俗来讲就是we are late可以单独成句，所以不需要what来做补充成分，我这样讲明白了吗...

that在这里没有实际的意义，实际上是起连接作用的一个连词，去掉that也可以成一个句子。这是一个常见的主谓宾关系的句子，the problem是主语，is是谓语，we are late是宾语从句。

这个不是定语从句，是表语从句，换成了WHAT句子就说不通了

that做定语，what是做宾语