在古代中国，工匠传统与学术传统分离，学者们关于物质的一些精辟论述没有引起工匠们的注意而付诸实验验证，工匠们的许多宝贵经验也往往不能得到学者们的重视，得不到总结整理，许多技术甚至—再失传。再如中国金丹设备大多不透明，不便于观察其中的反应变化；不注意气体的收集与研究；仅仅满足于用阴阳观念来解释复杂的物质变化；一般来讲，化学变化中的数量关系往往也没有受到应有的重视。这些都是中国古代化学本身的缺点或弱点。
