首先，根据我国物权法的规定，房屋等不动产的所有权取得以登记为要件，你没有办理登记前并没有实质取得该房屋所有权。
根据我国担保法的规定，办理不动产或动产抵押的，需要履行登记手续，不动产设立抵押的，到有关机关登记的，抵押合同有效，抵押权不设立。动产进行抵押的，未办理登记的，抵押合同有效，抵押权设立，但抵押权不能对抗第三人。
抵押合同有是否生效，公正不是必要要件，所以，你叔叔说要用房子做公正的意思应该是银行虽然能接受机器的动产抵押，但实际价值不够，所以还需要用你的房产来作抵押。
如果你购买的是开发商直接销售的新房，虽然未办理登记，但是实践中，以购房协议作抵押的，抵押权还是可以设立的。
也就是说，如果你叔叔无力偿还银行贷款的时候，银行是有权向法院起诉，请求法院就机器和你的房产主张抵押权，拍卖二项抵押物实现自己的债权。
那是公正，算是将你的房子一并抵押了吧
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