首先，玛雅文明至今尚未灭亡：在墨西哥尤卡坦半岛和中美洲的部分国家，仍然生活着几百万操玛雅语言、维持传统生活方式的玛雅人。所以这个问题，应该被修正成”玛雅文明衰落的原因“。
其次，玛雅文明在西班牙人入侵之前就衰落了，表现为人口减少、建筑水平和生活质量的下降。造成这种状况的主要原因，是玛雅文明的科技水平，特别是农业科技水平（刀耕火种的石器时代的原始农业）落后于人口的增长数度，从而导致生存资源的严重匮乏，进而引起战乱。
第三，西班牙人的入侵也极大地打击了玛雅文明：当时的西班牙处于欧洲中世纪后期的发展水平，和处于石器时代的玛雅文明相比要先进得多，天主教的强烈排他性也促使西班牙征服者有着强烈的摧毁异教文明的倾向。
最后，玛雅的传统文化自成体系，这也成为了一把双刃剑：一方面，玛雅人在西班牙人入侵后几百年的今天，仍然能保持其文化传统；另一方面，玛雅人在现代化的进程中步履维艰，至今未能完全融入墨西哥和中美洲的现代文明社会。
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