邻居的仓库倒塌,怪我们工厂的下水道排水,我们工厂建设排水已经十多年了，而邻居的仓库刚建两年，邻居

对方是违法建筑，楼主没有责任。法律只保护合法利益，违法建筑属于非法利益。

参见：
《最高人民法院关于贯彻执行《民法通则》若干问题的意见（修改稿）》
　　187．在诉讼中发现当事人在民事活动中有与本案有关的违法行为需要制裁的，可适用民法通则第一百三十四条第三款规定，予以训诫、责令具结悔过、收缴进行非法活动的财物和非法所得，或者依照法律规定处以罚款、拘留。
　　采用收缴、罚款、拘留制裁措施，必须经院长批准，另行制作民事制裁决定书。被制裁人对决定不服的，在收到决定书的当日内可以向上一级人民法院申请复议一次，人民法院应当在十日内将复议结果以书面形式通知申请人。复议期间，决定暂不执行。（见原163条）

《民法通则》
　　第一百三十四条　承担民事责任的方式主要有：
　　（一）停止侵害；
　　（二）排除妨碍；
　　（三）消除危险；
　　（四）返还财产；
　　（五）恢复原状；
　　（六）修理、重作、更换；
　　（七）赔偿损失；
　　（八）支付违约金；
　　（九）消除影响、恢复名誉；
　　（十）赔礼道歉。
　　以上承担民事责任的方式，可以单独适用，也可以合并适用。
　　人民法院审理民事案件，除适用上述规定外，还可以予以训诫、责令具结悔过、收缴进行非法活动的财物和非法所得，并可以依照法律规定处以罚款、拘留。