对方的医疗费应该由你弟弟垫付，前提是你弟弟有责任，如果没有责任的话，只需要承担交强险无责赔付，医疗限额是1000元。然后再拿着对方的医疗费发票等单据去保险公司索赔。对于你弟弟的农村合作医疗险和摩托车的驾意险，建议你先去保险公司索赔。
这种事故医院不会认农合的，先垫钱，等责任认定书出来后拿责任书和医院各类费用发票（有些药物不再报销类）找保险公司就行了，座位险应该是第三方责任险吧（不包括驾驶员吧），弟弟就用交强险吧
