A、由于F1绿色非条纹自交后代有绿色和黄色，说明绿色是显性性状，由于绿色纯合子致死，绿色对黄色是完全显性，A错误；
B、由于绿色非条纹自交后代有四种性状，且性状分离比为6：3：2：1，加上致死的个体，则比例为9：3：3：1，因此控制羽毛性状的两对基因自由组合，B错误；
C、F1的绿色非条纹的基因型为AaBb，黄色非条纹的基因型为aaBb，所以亲本P的基因型为Aabb和aaBB，C错误；
D、由于决定颜色的显性基因纯合子不能存活，所以F2中的绿色条纹个体全是杂合子，D正确．
故选：D．
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