本质上并没有多大区别，各家银行只是作为社保业务往来的结算平台。只不过因为现在是市场经济，比较注重自由化竞争以及用户体验，所以承办银行都会尽力推出更好用更便捷的社保卡业务以争取更多的客户体量，这样银行也能获得更大利益。至于为什么你和同事的社保卡不是同间银行，建议最好咨询一下你所在单位的人力部门。
