既然补偿合同签了，那合同里面肯定应订立了“出现房屋面积误差该如何处理”的条款。如同买期房订预售合同一样的道理。 按合同约定办最公平。万一你们没有事先书面约定，则只有协商解决了。
最好找专业的律师咨询，免得误事。
