医院建于1956年， 2000年获批“二级甲等中医医院”和“全省示范中医院”，2013年底通过二甲复审。是安徽省“北华佗、南新安”中医发展战略的重点建设单位。2013年纳入省中管局“省市共建、市区共管”的建设规划。2002年及2004年被中共亳州市委、亳州市人民政府授予亳州市第一届和第二届“文明单位”、2003年被省人事厅、省卫生厅授予“全省卫生系统先进集体”称号，四个科室获得市级“青年文明号”光荣称号。
