在1919年的《建国方略》中,孙中山把钦州港规划为我国南方第二大港,并赋之文曰:凡在钦州以西之地,将择此港以出于海,则比经广州可减400英里。海运比之铁路,运价廉20倍,节省400英里者,在四川、贵州、云南及广西之一部言之,其经济上受益为不小矣。孙中山那时所提的钦州港就是现在的钦州、防城港、北海三港,如今统称为北部湾港。而孙中山的这段话道出了新形势下北部湾联动大西南共襄发展的要旨所在。
长期以来,北部湾的港口之间因缺少统一规划、整合,导致各自为政。为此,广西于2007年2月14日对防城港务集团有限公司、钦州市港口(集团)有限责任公司、北海市北海港股份有限公司和广西沿海铁路股份有限公司的国有产权重组整合,成立了广西北部湾国际港务集团有限公司,主要进行港口建设及经营管理、地方铁路运输和公路运输等。广西壮族自治区人民政府2011年3月19日正式批准广西沿海防城港、钦州港、北海港统一使用“广西北部湾港”名称。因此,北部湾港实际包括防城港、钦州港、北海港三个部分 。
据统计,到2008年底,广西沿海港口共有生产性泊位191个,总吞吐能力达9420万吨。根据《广西北部湾经济区沿海港口总体规划》,广西沿海港口货物吞吐量2010年为1亿吨,2020年为3亿吨。
2012年,广西北部湾港吞吐量17437万吨,比上一年增长13.8%,实现了历史性突破。
2013年,北部湾港完成货物吞吐量1.87亿吨(规模以上),位居全国沿海规模以上港口第15位,同比增长7.09%;集装箱首次突破100万标箱,达到100.33万标箱,同比增长21.86%。