您好，感谢您的提问。
区别：1、公房一般指原来是单位或企业分给职工的住房，房改以后买成个人产权的是已购公房，基本都可以直接上市交易，没有买成产权的为使用权，不能直接上市交易。公房一般小户型多，物业管理费用低，房龄老，采光好，房屋使用面积大。
2、商品房是具有经营资格的房地产开发公司(包括外商投资企业)通过出让方式取得土地使用权后经营的住宅，均按市场价出售。商品房一般物业管理费比公房高一些，管理好一些，楼龄新，公摊面积大，大户型多一些，普遍而言，和公房相比，普遍而言使用面积相对小。
3、税费收的是不一样的，契税都是一样的，公房满两年就没有增值税，公房绝大部分是查不到原值的的，所以个税是1%征收，而商品房是收差额20%，而且商品房如果不满两年是有个全额的5.6%的增值税，满两年普通住宅则免收，满两年的非普通住宅则按差额的5.6%征收。
关于土地出让金原则上是由卖方来缴纳的。
希望能帮到您~~
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